現在環境監測系統的應用已經很多了，但是在制度管理上仍有所欠缺。建立管理制度的目的是要明確責任，使環境監測系統按照制定的管理制度有條理地運行，方便管理和維護。三水環境監測公司認為以下七大管理制度是很有必要的。

1.崗位責任制

制定崗位責任制主要是為了明確各管理人員的崗位責任，使其分工明確。

2.值班制度

該制度主要規定了在工作日要在上、中、下午分3次對子站進行監控，了解子站各環境監測設備的運行情況；在晚間、雙休日、節假日期間，在家里對子站進行監控。

3.中控室電腦的管理制度

主要內容是電腦要專機專用，要設置密碼，防止非環境監測人員對該機進行操作。

4.子站的運行維護管理制度

主要內容是定期對子站進行巡檢，作好維護記錄；在出現臺風、雷雨、大風、大雪等災害性天氣時，要做好事前的預防工作或者事后的巡檢工作。

5.備品、備件的管理制度

主要是建立電子管理文檔，做好備品、備件的入庫、出庫記錄，為采購計劃提供依據；保證常用、易耗物品的庫存數量。

6.環境監測站突發事件應急辦法

為了及時有效地應對子站設備在運行過程中遇到的突發性事件，有力地維護整個環境監測系統的運行，規定了一些針對各種環境監測儀器故障的應急處理方法和事后處理程序。

7.環境監測站系統數據管理制度

主要規定了每日要接收一次子站的數據，做好備份；每月做一次光盤備份。另外規定了數據上報的頻次，出現儀器故障時，要向上級提呈異常數據報告。

除了建立上述的管理制度外，對于環境監測系統還要建立起相應的一套文件體系，包括儀器檔案、運行檢查維護記錄、故障及修復記錄、儀器定期校準記錄、異常數據報告以及備品、備件電子文檔等。